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基因用PRIMER5翻译出来为什么和密码子不符?

2016-09-06技术资料

有段测序后的基因,其中有处是CTG,按密码子应该是D才对。但用PRIMER5整段翻译出来后却把他翻译成了E,这是为什么呢?而且查了文献,那个位置确实是E,弄不明白了啊。。。。我把软件的截图也放上好了,有问题的是蛋白的第71个氨基酸。  麻烦给仔细讲讲啊

你的东西我仔细看过了,CTG处是第70个碱基,而不是71个,所以你把我坑苦了,你软件翻译的没错,CTG密码用RNA的密码就是CUG(你的软件就是这样翻译过来的)所以编码Leu氨酸,而不是D氨酸。也许你说应该是上述密码的互补密码,CTG就翻译成GAC,GAC确实编码D氨基酸,但你的软件翻译时没有把密码互补后翻译,不信你可以仔细看一下,实验顺利啊


非常感谢啊,但我有点糊涂了。我这个基因是测序得到的,也比对过,可按你的说法这段链应该是和mRNA相同的那条链吗?或者说是3-5顺序的链?
我自己觉得它应该是5-3的啊,之后翻译成mRNA,所以密码子应该反过来才对啊。。。
 

是这样的,你把基因的正义连,反义链,编码链,非编码链搞混了,在《分子生物学》Robert F。 Weaver 著,郑用琏, 张富春, 徐启江等译的第三章有详细的介绍,你可以看一下。在一个就是tRNA的反密码子与密码子配对关系,还有DNA是双链的,这里边不是一两句话说清楚的,你可以仔细看一下书,实验顺利啊

 

这个不是多重要的东西,序列对就行了。

 
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